Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NUP35Q8NFH5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NUP35Q8NFH5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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