Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NUP35Q8NFH5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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