Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms