Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms