Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00518Q8N0U6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00518Q8N0U6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00518Q8N0U6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00518Q8N0U6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00518Q8N0U6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms