Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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