Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBRM1Q86U86 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBRM1Q86U86 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms