Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNDC1Q76NI1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms