Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP34Q70CQ2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms