Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms