Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms