Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAF7Q6Q0C0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms