Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms