Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms