Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms