Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNJQ5T5M9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNJQ5T5M9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms