Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms