Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms