Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF8Q3BBV2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms