Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NTRK2Q16620 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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