Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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