Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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