Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TNXAQ16473 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TNXAQ16473 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TNXAQ16473 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TNXAQ16473 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TNXAQ16473 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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