Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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