Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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