Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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