Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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