Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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