Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDH18Q13634 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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