Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CUL4AQ13619 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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CUL4AQ13619 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CUL4AQ13619 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CUL4AQ13619 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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