Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STX4Q12846 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STX4Q12846 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms