Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms