Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms