Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMSAP2Q08AD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAMSAP2Q08AD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP2Q08AD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms