Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms