Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms