Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK18Q07002 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms