Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms