Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3AQ05086 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms