Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms