Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMX2Q04743 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms