Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms