Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms