Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA1P59665 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA1P59665 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms