Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL3P58872 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL3P58872 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms