Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms