Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A1P53007 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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