Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXA1P49639 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA1P49639 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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