Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms