Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms