Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRPPRCP42704 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRPPRCP42704 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms